《人民日報》發表評論，指昨晚（21日）黑衣人在西鐵元朗站「瘋狂破壞」，港鐵公司不僅拖延報警，事後更派專列護送，讓「暴徒」免費乘車，「這一幕讓人看不懂」。評論稱，任何公營機構一旦縱容暴力，就是拿公共安全不當回事。港區全國人大代表陳曼琪亦在facebook質疑港鐵「包庇暴徒」，要求港鐵主席歐陽伯權回應。
港鐵晚上發出聲明表示，曾因應警方在個別鐵路車站附近的驅散行動，在「顧及乘客和員工的大前提下」，安排特別列車服務，包括已載客列車不停受影響車站，以及安排無載客列車直接到有關車站接載乘客離開。
惟鑑於近期「多次有人故意破壞車站內設施」、影響車務正常運作，以及辱罵車站職員、甚至「威脅他們人身安全」，港鐵稱將就車務安排「作出新的應對」，若站內發生打鬥、破壞及其他暴力事件，港鐵有可能在沒有預先通知下，即時停止有關車站運作及列車服務，甚至關閉車站；「公司亦明白警方在有需要時，會進入車站執法」。
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